Obiettivi e servizi offerti
La Piattaforma di Sequenziamento è stata istituita presso il Dipartimento di Medicina Sperimentale e Clinica (DMSC) dell’Università di Firenze, con sede principale presso i laboratori del Padiglione 27b / Cubo3 del Complesso Polivalente Cubo, Viale Pieraccini 6, con l’obiettivo di mettere a disposizione dei ricercatori le strumentazioni, il patrimonio di conoscenze e le competenze tecniche, acquisite dal personale della piattaforma nel corso di decenni.
La piattaforma nasce come infrastruttura condivisa, accessibile non solo ai ricercatori del Dipartimento di Medicina Sperimentale e Clinica e degli altri Dipartimenti dell’Università di Firenze, ma anche a studiosi di altri Atenei e centri di ricerca nazionali e internazionali, pubblici e privati. Essa rappresenta un’infrastruttura tecnologica avanzata, dedicata all’analisi genomica, trascrittomica e molecolare, a supporto di attività di ricerca di base, traslazionale e applicata.
Le principali applicazioni offerte dalla PIATTAFORMA DI SEQUENZIAMENTO sono:
• Whole-genome sequencing (WGS)
• Whole‑exome sequencing (WES)
• Targeted sequencing
• mRNA‑Sequencing (bulk / single-cell)
• Total RNA sequencing (include forme di RNA codificante e non codificante)
• Single‑cell RNA‑Sequenicng
• Immune repertoire sequencing – identificazione dei reperti di recettori immunitari (TCR/BCR).
• Metagenomics / Microbiome profiling
• Genotyping e analisi delle varianti
• Methylation sequencing (con workflow integrati whole methylation / RRBS)
• Sequenziamento di ampliconi e prodotti di PCR.
• Sequenziamento di plasmidi e inserti clonati.
• Conferma di sequenze target dopo amplificazione o editing genetico.
• Validazione di polimorfismi (SNP), mutazioni a singolo nucleotide e piccole indel (SNV, Indel).
• Studio di microsatelliti, STR (Short Tandem Repeats), elementi ripetuti
• Analisi di indici di perdita di eterozigosi (LOH) e genotipizzazione.
• Applicazioni su analisi di frammenti SNP, AFLP, e genotipizzazione su panel di loci.
Il personale della Piattaforma di Sequenziamento fornirà un adeguato supporto di consulenza tecnico-scientifica preliminare alla fase sperimentale in base alle necessità di ricerca e al livello di competenze del ricercatore proponente, rendendosi inoltre disponibile per attività di collaborazione scientifica e per il supporto a ricercatori esterni attraverso l’accesso a strumentazioni avanzate e competenze specialistiche.
Ultimo aggiornamento
16.04.2026